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硅藻死后,其以硅质成分为主的细胞壁保存下来形成的化石。发现于世界各地侏罗纪至现代各海、陆相地层中,对地层学尤其对古生态、古气候环境的研究有很大价值。常大量堆积形成硅藻软泥、硅藻土。在化石形成过程中,藻体内分解的脂肪物质是形成石油的原料之一。