郡门下吏名。汉代置，《汉书·黄霸传》记霸“为颖川太守，秩比二千石，居官赐车盖特高一丈，别驾主簿车缇油屏，泥于轼前，以章有德。”别驾主簿的地位高于一般郡主簿，总录众事，出则别乘驿车随行，相当于州职中的别驾从事。