北周末改南兖州置，治所在谯县 (今安徽亳州市)。据 《续通典》 称： “遥取古南亳之名以名州。”隋大业三年 (607) 改为谯郡。唐武德四年 (621) 复为亳州。天宝元年 (742) 改为谯郡。乾元元年(758) 又曰亳州。辖境相当今安徽亳州、涡阳、蒙城及河南鹿邑、永城等市县地。元属归德府。明洪武初废谯县入亳州，寻降亳州为亳县。弘治九年 (1496)复升为亳州，属凤阳府。清属安徽颍州府。1912年改为亳县。元末刘福通起义，立韩林儿为帝，曾建都于此。

北周末改南兖州置，治小黄县(隋改名谯县，今安徽亳州市)。隋大业初改为谯郡。唐武德、乾元初复为亳州。辖境相当今安徽省亳州、涡阳、蒙城及河南省鹿邑、永城等市县地。明初以州治谯县省入，辖境缩小，寻降为县，弘治九年(1496年)复升为州。清雍正二年(1724年)升为直隶州，不辖县。1912年改为县。元末刘福通起义，立韩林儿为帝，曾建都于此。