六卷。明吕元善(生卒不详)撰。吕元善，字季可，号冠洋，海盐(今浙江省海盐县)人。明天启年间(1621－1627)贡生，官至山东布政司都事。《圣门志》记载孔氏诸家世系、孔门弟子及后代理学诸儒事迹，分圣门表传、从祀列传、四氏封典、礼乐、古迹、东野氏和仲氏世系六卷，六卷内又分六十五子目。吕元善做山东布政司都事时，广泛搜寻孔氏诸家谱牒，辑其宗系编成《圣门志》，并在孔门弟子后附记后代理学诸儒。但该书收录体例不一，如与理学诸儒无关的内阁魁名及岳飞等也列入儒林为记，还收入未入祀典的拟祀诸儒三十五人，冗杂芜乱。吕元善书成后未付印，其子吕兆祥又重加校订，海盐令樊维城为刻入《盐邑志林》中，末附崇祯初曲阜祠祀元善及四氏子孙等给匾案牍，以致更为冗杂。现存明崇祯二年刻本，收《北京图书馆古籍善本书目》。《四库全书总目》载该书为江苏巡抚采进本。