三十卷。唐朝司马贞撰。司马贞，字子正，自号小司马，河内(河南沁阳)人。官至散大夫，弘文馆学士。撰《史记索隐》及《补三皇纪》三十卷。生卒年不详，约开元中人。当初与张嘉会共撰索隐。有褚少孙补司马迁书，又有裴骃集解的音义，但散佚，邹诞生、柳雇言的书亦失传；刘伯庄、许子儒等人的书又多疏漏，于是就专心注司马迁书，只标出所注的字，不抄原文，又作《述赞》一百三十篇，及补《史记》条例，最后补作《三皇本纪》一篇，《索隐》中批评《史记》，认为项羽不该列入本纪，而应该列入世家；陈涉不该入世家，而应列入列传。《三皇本纪》题名小司马氏，采录各种传说，并加了注解，宋代以来各种刻本都列在书首，清殿本改附在全书之后，《老子庄周列传》与《伯夷列传》《申不害·韩非子》同一卷。有广雅书局本、汲古阁本、毛氏单刻本。现通行本《史记》中均附有司马贞的《史记索隐》。